Colossal Biosciences 发布 AI 平台 GenoMorph，加速渡渡鸟等灭绝物种复活

Colossal Biosciences 周三宣布 推出一个新的人工智能平台,以帮助加速其复活已灭绝物种的工作,TechCrunch 独家报道。 

该平台名为 GenoMorph,利用先进的 3D 形态学、比较基因组学和发育生物学来识别可在基因数据有限的复活项目中进行编辑的基因。该公司将其作为复活渡渡鸟计划的一部分加以使用,而可用于参考的渡渡鸟基因组非常有限。 

例如,该公司目前只能获得一个渡渡鸟基因组,而作为其猛犸象复活项目的一部分,它已经获得了 100 个基因组。该公司表示,猛犸象的 DNA 更为充足,因为这种动物所生活的寒冷气候比渡渡鸟生活的热带地区更能保存 DNA。

"通常情况下,科学家可以通过比较多个基因组来了解哪些基因差异导致了特定的性状," Colossal 首席执行官兼联合创始人 Ben Lamm 接受 TechCrunch 采访时表示,"对于 DNA 极为稀缺的已灭绝物种的古代 DNA,我们没有这样的条件,我们只能获得少量完整的基因组。" 

Lamm 表示,为构建 GenoMorph,该公司从"鸡、鹌鹑、鸭子和鸽子"身上收集了大量发育数据,并将其与"70 多种鸟类的遗传信息和 3D 头骨测量数据"相结合。他表示,构建该平台耗时超过一年,这也是建立在该公司多年来在物种复活领域工作基础之上的成果。 

"AI 会学习在不同鸟类发育喙部和面部结构的过程中,DNA 的哪些区域处于活跃状态,并利用这些信息来预测哪些基因开关可能赋予了渡渡鸟其标志性的外观。"他表示,可以将该平台视为"渡渡鸟基因组的藏宝图",GenoMorph 可以帮助 Colossal 团队直接找到那些真正重要的基因差异,而不是在大量潜在的基因差异中大海捞针。 

"到目前为止,我们已经识别出大约 2,300 个针对渡渡鸟颅面形态的有前景的 DNA 编辑靶点,现在可以在实验室中进行测试,"他继续说道。他表示,GenoMorph 将帮助该公司解决其复活灭绝动物工作中最大的瓶颈之一 —— 即找出哪些变化真正使一个灭绝物种独一无二。但 Lamm 同时指出,科学家还需要测试这些编辑能否产生所需的物理特征。 

"我们开发了一个新系统,利用脂质纳米颗粒将基因编辑工具直接递送至发育中的鸟类胚胎,"他说道。这将帮助团队观察某些基因变化如何影响鸟类的发育,"而无需等待鸟类达到性成熟所需的整个繁殖周期。" 

该公司还在周三宣布,其尼科巴鸽种群目前已有 36 只鸟,并已成功培育出可发育成卵子和精子的关键细胞。

“因为尼科巴鸽是渡渡鸟现存最近的近亲，这些细胞是我们培育具有渡渡鸟特征鸟类的关键一环。”他表示。该公司接下来希望在实验室中验证 GenoMorph 的预测。“最令人兴奋的是，我们此前一直在开发的各项技术正在汇聚到一起，并助力我们在生命树完全不同的分支上开展的其它项目。”Lamm 继续说道。

在被问及以这种方式编辑基因是否安全时，Lamm 表示，开发像 GenoMorph 这样的技术旨在让基因工程“更精确、更可控、更可验证”。他指出，该产品本身并不直接编辑基因，而是帮助团队确定哪些基因变化值得研究。

他继续说道：“识别出一个潜在的编辑位点并不意味着我们会立刻将其引入动物体内，也不代表我们就认为它是安全的。我们能够越精确地识别和验证这些变化，我们在整个过程中做出的决策就会越有依据。”

与此同时，Colossal Biosciences 的最新技术已获得 XPRIZE 创始人 Peter Diamandis 的认可。作为 Colossal 的投资人，Diamandis 于周三宣布，他已创立了一家新的风险投资公司 NeoGenesis Capital，以支持在健康、农业和保护领域使用 Colossal Biosciences 可编程生物学平台的公司。

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Dominic-Madori Davis 是 TechCrunch 资深风险投资与初创公司记者，常驻纽约市。

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